Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC93Q567U6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms