Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms