Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

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Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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