Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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