Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms