Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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