Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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