Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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