Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITSN1Q15811 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITSN1Q15811 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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