Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PDCD1Q15116 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms