Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLD3Q15054 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243 ms