Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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DDX39BQ13838 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DDX39BQ13838 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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