Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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RUNX3Q13761 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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RUNX3Q13761 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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RUNX3Q13761 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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