Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMB3Q13751 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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