Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL1Q13616 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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