Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ATRQ13535 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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