Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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