Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NFX1Q12986 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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