Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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