Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms