Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FOXO1Q12778 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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