Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF5Q12774 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF5Q12774 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms