Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CGNL1Q0VF96 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms