Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms