Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms