Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF4Q08170 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms