Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POU5F1Q01860 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms