Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN7AQ01118 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms