Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F1Q01094 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms