Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIC1P78348 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIC1P78348 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms