Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
HBBP68871 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms