Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms