Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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