Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms