Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AFDNP55196 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AFDNP55196 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AFDNP55196 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AFDNP55196 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AFDNP55196 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AFDNP55196 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AFDNP55196 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFDNP55196 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFDNP55196 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFDNP55196 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFDNP55196 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFDNP55196 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFDNP55196 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AFDNP55196 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms