Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MANFP55145 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MANFP55145 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MANFP55145 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MANFP55145 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MANFP55145 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MANFP55145 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MANFP55145 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MANFP55145 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MANFP55145 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MANFP55145 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MANFP55145 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms