Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
UBE2E1P51965 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms