Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP4P49662 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP4P49662 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP4P49662 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP4P49662 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP4P49662 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP4P49662 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP4P49662 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP4P49662 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP4P49662 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms