Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms