Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF4P48230 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms