Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MDH1P40925 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MDH1P40925 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MDH1P40925 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MDH1P40925 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MDH1P40925 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MDH1P40925 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms