Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPB2P35606 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPB2P35606 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms