Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNA1P35221 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms