Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
OTX2P32243 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
OTX2P32243 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
OTX2P32243 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
OTX2P32243 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
OTX2P32243 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
OTX2P32243 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
OTX2P32243 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
OTX2P32243 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms