Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFNP31947 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFNP31947 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFNP31947 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFNP31947 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms