Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PTPRMP28827 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRMP28827 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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