Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLD1P28340 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms