Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSFA2P28290 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSFA2P28290 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms