Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO2P25791 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LMO2P25791 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMO2P25791 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms