Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms